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（一）潜伏期一般为2～3天，最短1天，最长7天。
（二）临床分期
1．上呼吸道感染期：鼻炎、咽炎、或鼻咽炎，极少数患儿以结膜炎为主要体征。
2．败血症期：起病急，突发高热，恶心呕吐，头痛及全身痛，惊厥，精神极度萎靡，面色苍白或发绀，四肢厥冷，脉搏细速，皮肤粘膜出现出血点并呈红色针尖大，迅速增多，扩大，互相融合成片，常见于肩、肘、臀等皮肤受压部位和口腔粘膜或眼结膜。病重时出血点可在数小时遍布全身，并融合成大片瘀斑，其中央呈紫黑色坏死。
3．脑膜脑炎期：多数患儿发病24小时左右即出现颈项强直、克氏征和布氏征等脑膜刺激征，剧烈头痛、频繁呕吐、烦躁不安或嗜睡，重者昏迷。此期仍有高热和出血点，脑脊液呈典型的化脓性改变。由Nm 引起的混合性败血症－脑膜脑炎较单纯性脑膜脑炎更常见，临床上既表现为败血症症状，又表现为脑膜脑炎症状。
4．免疫反应期：由免疫复合物反应所引起的一些临床表现。多见于病后7～14天，以关节炎较明显，多侵犯膝、腕、肘或踝关节，可同时出现发热，亦可伴有心包炎。关节积液或心包积液多为无菌性，关节积液有时可检出IgM、C3或Nm抗原。
（三）临床分型
流脑病人病情轻重程度明显不同，临床症状亦轻重悬殊，可分为以下几种临床类型。
1．普通型此型约占发病者的90％。起病急、寒战、高热、头痛、全身痛和呕吐，皮肤粘膜出现出血点，脑膜刺激征阳性。婴幼儿表现多不典型，常表现为烦躁、啼哭不安、惊厥、拒食、前卤隆起而无颈项强直。
2．暴发型少数病儿发病更急剧，病情变化迅速，病势险恶，病死率高。此型又可分为以下三个型：
（1）暴发型败血症型（休克型）严重中毒症状，急起寒战、高热、头痛、惊厥，面色苍白、唇周与肢端轻度紫绀，皮肤发花、四肢厥冷、脉搏细速、呼吸急促。若抢救不及时，病情可急速恶化，出现重症休克，周围循环衰竭症状加重，血压显著下降，甚至测不出。尿量减少，甚至会出现无尿，神志昏迷。瘀点迅速增多，且可融合成片，但还应注意有的病儿休克严重，瘀点或瘀斑并不多，常无脑膜刺激征，脑脊液亦无显著异常，大多澄清。
（2）脑膜脑炎型出现一系列颅内压增高症状，病情变化快，突出表现为剧烈头痛、烦躁不安、频繁呕吐、惊厥、肌张力增强，四肢强直，重者角弓反张。神志恍惚，急速转入昏迷。面色苍白，血压升高。瞳孔改变，呼吸变慢，甚至会出现中枢性呼吸衰竭症状。部分病人可发生脑疝。